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ORCA调用xtb

xTB方法是Grimme组提出的一种新颖的半经验方法,写完整了叫做GFN-xTB方法,目前xTB已经推出到第二代。相比PM系列半经验方法,最...

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历遍目录下文件

命令行历遍文件主要的目的还是处理一些问题清晰,只不过所使用的工具不支持glob选择方法, 又不是很想去用代码套一个壳子的情况下,迅速解决问题。...

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一种生成蛋白结构空腔的方法

本文暂时主要讨论使用Hollow1生成点群然后使用PyMOL可视化。 Hollow是以Python编写的程序,技术上在Python2/3上都能...

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OpenBabel构造小分子二聚体

受这篇论文1启发,可以通过linker构造一个小分子的二聚体, 进而间接完成二聚配体的分子对接。 本实例采用openbabel 3.x from openbabel import pybel, openbabel mol1 = pybel.readstring('smi','CC(C)C')...

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无显示器播放视频

有的时候ssh到远程服务器之后,希望能够测试一下视频文件是否正常, 固然可以开一个简易的web服务器,把视频文件下载下来,播放看一下。 但由于只...

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